אחד ממקורות התשואה היחידים שנותרו פטורים ממס הינם רווחים שנצברו על כספים המופקדים בקרן השתלמות ובלבד שמקורם בתקרת ההפקדה המוטבת (כיום שכר של לא יותר מכ- 15,700 ₪). מוטב בקרן השתלמות נהנה לפיכך בעת משיכת הכספים מהפטור המנוי בסעיף 9(16א) לפקודה, לרבות רווחים שנצברו בגינם לאחר תום תקופה של שש שנים.הפטור יחול גם לגבי כספים שהופקדו מיום 1.1.2003 ואילך, כחריג.
אמור לפיכך, כי משיקולי מס בלבד אי משיכת כספים מקרן השתלמות בכפוף לתקרת ה"הפקדה המוטבת" והשארתם בקרן ההשתלמות אף לאחר שש השנים, וכן המשך הפקדת כספים בקרן נזילה כאמור, כבתוכניות חיסכון / פיקדון לכל דבר, יקנו למוטב פטור ממס לכספי הרווחים שיצברו בפדיון, בכל עת.
הלוואות מקרן השתלמות – גם במצב בו החוסך נוטל הלוואה מקרן השתלמות, תנאי הפטור ממס על הרווחים נשארים אותו הדבר. לכן חברות הביטוח השונות מאפשרות לקחת הלוואות בסכומים גדולים יחסית ביחס לגובה הקרן.