סעיף 89(ב)(3)(ב) לפקודת מס הכנסה קובע כי במכירת נכס הנמצא מחוץ לישראל שהוא בעיקרו זכות בעקיפין או במישרין לנכסים בישראל, כגון מניות בחברה זרה, יקום חיוב במס בישראל על חלק "התמורה" הנובע מרכוש בישראל. קביעה כאמור אינה עולה במרבית המקרים בקנה אחד עם האמנות למניעת כפל מס עליהן חתומה ישראל לפיהן זכות מיסוי תושב מדינת האמנה בגין רווחי הון ממימוש נכסים, אף אלו המצויים בישראל (במרבית המקרים, כל עוד אינם נכסי מקרקעין) נתונה למדינת האמנה – מדינת תושבתו של תושב החוץ.
לפיכך יש לדעתנו מקום פרשנות כי תושב מדינה זרה, על פי מרבית מדינות אמנות המס, המוכר מניות חברה זרה אשר מרבית נכסיה מצויים בישראל לא יחויב במס בגין מכירת מניותיו בחברה הזרה, על אף הוראות סעיף 89 כאמור לעיל. הננו להפנות תשומת לבכם כי הקביעה האמורה ראוי לבוחנה בזהירות בכל הקשור ל- "איגוד מקרקעין" כמשמעות מונח זה בחוק מיסוי מקרקעין ותיקון 50 לחוק האמור.
